El proyecto es diseñado con altos estándares técnicos para cual el Programa contrata una consultoría experta. En la formulación participan profesionales de la institución beneficiada y del Ministerio de Hacienda.
El proyecto es presentado por el órgano público interesado al Comité Estratégico, para que éste lo apruebe, rechace o requiera ciertos ajustes. Una vez aprobado por el Comité, es enviado al BID para su no objeción.
El proyecto aprobado es ejecutado por el servicio público beneficiario, con el apoyo técnico y bajo la supervigilancia de la Unidad Coordinadora del Programa y la asesoría del BID. Financieramente, se transfieren recursos desde el Ministerio de Hacienda.
Durante la ejecución del proyecto, se desarrollan instancias periódicas de evaluación, incluyendo el seguimiento online por parte de la ciudadanía.